hm, ganz verstehe ich das Problem nicht: Sind das selbsterstellte Vertonungen? Falls ja, dann würden Sie die - nach all dem Aufwand, sie zu erstellen - vermutlich ohnehin nicht vollständig löschen, oder? Was ist dann aber problematisch an einer 1-GB-Datei?
Sie können unter "Bearbeiten / Media-Dateien", Registerkarte "Audio" unten einstellen, in welche Media-Sammlung neu erstellte Vertonungen gespeichert werden sollen. Standardmäßig ist "Audio_XYZ_User_Main" eingestellt, aber statt "Main" können Sie (Schaltfläche "+ ...") auch etwas anderes eingeben (z.B. "BWL" etc.). Das bezieht sich dann allerdings nur auf neu erstellte Vertonungen, d.h. die bislang nach "...Main" gespeicherten Vertonungen werden davon nicht beeinflusst.
Mit dem Menü "Bearbeiten / Media-Sammlungen erstellen" können Sie Vertonungen von einer Media-Sammlung in eine andere kopieren ("Quelle: Bestehende Media-Sammlungen"); dazu stehen auch einige Filterkriterien zur Verfügung, wobei ich nicht weiß, ob Sie damit eine Trennung nach Fächern nachträglich hinbekommen.
> Unter Sprachinhalt trage ich immer ein: Kein_Sprachinhalt__1
Hm, gedacht ist es eigentlich so, dass Sie die Sprache einstellen, die in den Vertonungen jeweils gesprochen wird. Wenn Sie deutsche Wörter oder Sätze einsprechen, sollten Sie "Deutsch" einstellen (das ergibt dann die Media-Sammlung Audio_DEU_User_Main), bei der Aufnahme englischer Wörter und Sätze "Englisch" (Audio_ENG_User_Main) usw. - "Kein Sprachinhalt" (Audio_ZXX_User_Main) ist eigentlich nur sinnvoll, wenn Sie z.B. die Klänge von Musikinstrumenten oder andere nicht-sprachliche Geräusche aufnehmen wollten. Sie können die angegebene Sprache übrigens im Nachhinein ändern, indem Sie schlicht per Windows Explorer die Media-Sammlung umbenennen und "ZXX" z.B. durch "DEU" ersetzen (wobei .mi4- und .md4-Datei bis auf die Dateiendung denselben Namen haben müssen!) Anschließend bitte den Vokabeltrainer neu starten.